根據(jù)國務院“三定方案”中明確水資源司“指導各行業(yè)水平衡測試工作”的要求，自1998年水利部以文件形式要求全國開展水平衡測試工作后，多數(shù)地區(qū)水行政主管部門陸續(xù)管理和開展了水平衡測試工作。各省(市、自治區(qū))水平衡測試工作的管理機構主要有以下幾種形式：

省級水行政主管部門，如寧夏、上海、內蒙古等地；

省級水資源管理辦公室或節(jié)約用水辦公室，如北京、天津，遼寧，山東、貴州等地；

重慶市由輕工能源監(jiān)測站管理，河北省由水平衡測試中心管理，還有一些省份沒有明確的管理機構。

資質管理工作層面上水利部頒發(fā)的《水文、水資源調查評價資質》中包含“水平衡測試”資質，目前各地水文局也是水平衡測試工作的主要測試隊伍；

地方層面上情況不統(tǒng)一，部分省市對水平衡測試機構的資質管理歸在水行政主管部門，部分省市由質量技術監(jiān)督部門管理，部分省市由發(fā)改委能源局管理，還有個別省市對測試機構的資質管理無要求。